More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0065 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0065  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  520  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0605636  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  60.85 
 
 
228 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4410  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.1 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.994375  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1632  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.26 
 
 
250 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  55.14 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  47.81 
 
 
235 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3749  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
228 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.87 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  49.77 
 
 
228 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.05 
 
 
221 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4082  cyclic nucleotide-binding  45.71 
 
 
220 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.76 
 
 
220 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.16 
 
 
221 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.64 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.17 
 
 
225 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.11 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.17 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4447  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  34.64 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.11 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.89 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  25.82 
 
 
355 aa  68.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  25.29 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  26.57 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.21 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.67 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.4 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.37 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  22.4 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.67 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  26.2 
 
 
224 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  25.23 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.11 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.06 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.35 
 
 
348 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.34 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25.86 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  22.05 
 
 
218 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.33 
 
 
223 aa  62  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.3 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.11 
 
 
225 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>