69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1664 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  85.53 
 
 
155 aa  251  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  85.53 
 
 
155 aa  249  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  57.62 
 
 
163 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  49.69 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  50 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
153 aa  92  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  37.25 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  35.66 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.27 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  33.8 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  32.39 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  30.52 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  36.72 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  36.22 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  29.33 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.72 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.38 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.59 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  35.43 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.31 
 
 
222 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.49 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  35.65 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.8 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.52 
 
 
239 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
232 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  27.27 
 
 
194 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  25.4 
 
 
570 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 
209 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
231 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
260 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.25 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
230 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  31.11 
 
 
680 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  31.11 
 
 
680 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 
472 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  27.33 
 
 
225 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  23.91 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.2 
 
 
242 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  26.92 
 
 
729 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
241 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  25.85 
 
 
148 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  24.48 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  24.09 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
226 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  32 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  22.52 
 
 
357 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
228 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
263 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 
234 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1996  cAMP-binding protein  24 
 
 
1002 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  32.98 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04560  glutaminase  38.46 
 
 
615 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 
234 aa  41.2  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  28.87 
 
 
250 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
234 aa  40.8  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>