38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0350 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0350  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 164 aa  331  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  31.34 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 228 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  26.57 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  28.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  27.91 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  27.91 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 454 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  26.55 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.65 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.68 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2556  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 153 aa  42  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 229 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 248 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 227 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 		 417 aa  41.2  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 222 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  22.22 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 		 435 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>