118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0972 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 122 aa  174  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.1 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  55.28 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  54.24 
 
 		 119 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  50.41 
 
 		 123 aa  136  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  52.85 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  38.98 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.66 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  36.96 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.96 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  25.24 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  25.24 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  24.76 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.99 
 
 		 1075 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 141 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 238 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  30.89 
 
 		 346 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30.43 
 
 		 606 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 219 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 226 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  31.43 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.07 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 		 435 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 		 454 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 		 563 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 454 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  24 
 
 		 263 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.07 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 219 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.7 
 
 		 644 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1632  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 237 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  25.37 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 355 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 417 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  31.58 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4082  cyclic nucleotide-binding  28.12 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0691  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.04 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.275069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 253 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  23.76 
 
 		 419 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4410  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.994375  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 225 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.52 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  31.5 
 
 		 251 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 		 570 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_002620  TC0506  cyclic nucleotide-binding protein, putative  29.59 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.191962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0150  ribonuclease BN-like family protein  35.06 
 
 		 435 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  28.32 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.07 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  34.72 
 
 		 504 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 353 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.42 
 
 		 613 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5944  cyclic nucleotide-binding  26 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25.42 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0335  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.94 
 
 		 414 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4383  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  31.94 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  28.28 
 
 		 161 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  28.85 
 
 		 577 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 148 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 248 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 225 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5468  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.907492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3615  cyclic nucleotide-binding protein  28.45 
 
 		 412 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3442  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 		 563 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352677  normal  0.0673657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  33.87 
 
 		 482 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0350  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>