114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1398 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 168 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  77.03 
 
 		 149 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  63.83 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  51.61 
 
 		 155 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  51.61 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  40.29 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.29 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  42.66 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  39.74 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  41.43 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  41.43 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  41.43 
 
 		 152 aa  87.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  38.78 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  38.17 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  37.68 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  37.69 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.06 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  32.62 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  34.07 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  38.83 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.39 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.67 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  27.44 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  28.38 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  30.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  28.77 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  26.57 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  28.77 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.09 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4086  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0944516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 472 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.46 
 
 		 226 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  26.12 
 
 		 923 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 435 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  26.71 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2556  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 278 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.9 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.66 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 308 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.82 
 
 		 237 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0350  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 228 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 232 aa  44.3  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.6 
 
 		 231 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 570 aa  44.3  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  28.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  27.89 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.97 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 		 860 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  31.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2104  cyclic nucleotide-binding protein  32.91 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.536929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  30.6 
 
 		 622 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  31.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  31.86 
 
 		 266 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  23.89 
 
 		 275 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 234 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2535  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 228 aa  42  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  20.97 
 
 		 868 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 801 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 1177 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.75 
 
 		 243 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.48 
 
 		 225 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 226 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.75 
 
 		 243 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 235 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 235 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 		 254 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>