171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1016 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
156 aa  316  9e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.05 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  56.76 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  54.05 
 
 
152 aa  167  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  49.01 
 
 
152 aa  160  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  45.33 
 
 
156 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.86 
 
 
160 aa  130  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  47.65 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  38.41 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  34.01 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.23 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.25 
 
 
225 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.03 
 
 
224 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.56 
 
 
242 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.97 
 
 
225 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.87 
 
 
226 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
225 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
252 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
234 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.67 
 
 
224 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  26.5 
 
 
245 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.86 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.83 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.13 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  32.33 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.21 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0631  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 
235 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.49 
 
 
226 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
228 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 
237 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.22 
 
 
228 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.19 
 
 
226 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
230 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
232 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
230 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
230 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
230 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 
224 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.21 
 
 
243 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  35.05 
 
 
731 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
254 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.86 
 
 
254 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
226 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
228 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  28.15 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  35.11 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
240 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.17 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
249 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
224 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
254 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.56 
 
 
1016 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
224 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
228 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
224 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
222 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  24.82 
 
 
230 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  25.21 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  32.71 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  32.35 
 
 
225 aa  47.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.22 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1987  regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases-like  27.34 
 
 
236 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.48 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.5 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 
482 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  38.67 
 
 
1048 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.95 
 
 
227 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
231 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.85 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  29.45 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
228 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  42 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  29.66 
 
 
620 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.53 
 
 
239 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  28.44 
 
 
235 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
237 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.95 
 
 
171 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 
253 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 
482 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.57 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30 
 
 
224 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
223 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>