67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1532 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1532  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.31549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3434  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3652  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0096364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  26.81 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04370  cyclic nucleotide-binding protein, hydrogenase accessory protein, HoxI  29.46 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  26.09 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0504  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2587  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1016  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  27.43 
 
 		 469 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4499  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2663  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3582  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 		 554 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0031716  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  32.63 
 
 		 747 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  27.13 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3861  transcriptional activator FtrB  23.97 
 
 		 256 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0595  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.130469  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.41 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.59 
 
 		 235 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2037  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 		 472 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00604433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.8 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 		 388 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.22 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  27.05 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  31.67 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.4 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.44 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  26.13 
 
 		 357 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.67 
 
 		 227 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0386  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 340 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  31.76 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.46 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2258  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 487 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.02 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3081  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 249 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0390484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  21.32 
 
 		 738 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.21 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2519  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.08 
 
 		 492 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.806579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  27.61 
 
 		 640 aa  40.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3086  cyclic nucleotide-binding protein  27.43 
 
 		 615 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.238532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2709  transcriptional activator FtrB  21.71 
 
 		 232 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2331  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.95 
 
 		 561 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148214 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2726  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.37 
 
 		 322 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  27.47 
 
 		 625 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>