More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0611 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  100 
 
 
738 aa  1538    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  26.45 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
430 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 
436 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 
433 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
436 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 
436 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
428 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
428 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  25.66 
 
 
428 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0593  hypothetical protein  96 
 
 
50 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
428 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
428 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07917  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
460 aa  97.8  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  23.53 
 
 
435 aa  97.8  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 
444 aa  97.8  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
428 aa  97.8  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02230  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_8G05850)  25.97 
 
 
459 aa  97.4  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000761243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  26.27 
 
 
430 aa  97.4  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
423 aa  97.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
428 aa  96.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  26.7 
 
 
430 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
427 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  26.68 
 
 
430 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  26.16 
 
 
428 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  26.94 
 
 
430 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
428 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
428 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
428 aa  95.5  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
428 aa  95.1  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
425 aa  95.1  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
431 aa  94.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
428 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
445 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
425 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00860  conserved hypothetical protein  24.09 
 
 
516 aa  94  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
427 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
444 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
444 aa  94  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
436 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
433 aa  92  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
432 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 
445 aa  91.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 
431 aa  91.3  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
440 aa  90.9  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
434 aa  90.5  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
436 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
428 aa  90.5  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
430 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  22.98 
 
 
432 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
433 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1418  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 
381 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
434 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
442 aa  89  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
428 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
427 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
427 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
431 aa  87.4  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
427 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
427 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 
427 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
433 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 
433 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  24.82 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  23.1 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
428 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  25.49 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  23.82 
 
 
430 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 
494 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
435 aa  83.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.79 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 
478 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
415 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  24.94 
 
 
470 aa  82  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  24.54 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.55 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
426 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  22.9 
 
 
433 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 
433 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.51 
 
 
426 aa  80.1  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  25.55 
 
 
426 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>