292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1900 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  54.74 
 
 		 622 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 640 aa  1307    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  45.83 
 
 		 625 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.11 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  27.01 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.91 
 
 		 618 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.43 
 
 		 644 aa  194  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  25.6 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.6 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  24.92 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  25.56 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  26 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.59 
 
 		 620 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  25.42 
 
 		 620 aa  187  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.55 
 
 		 637 aa  183  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  23.87 
 
 		 622 aa  183  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 629 aa  181  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.96 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  24.96 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  24.11 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  24.87 
 
 		 615 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  26.7 
 
 		 646 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 		 623 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  25.04 
 
 		 634 aa  179  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 485 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.01 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  22.98 
 
 		 618 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  24.88 
 
 		 606 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  22.91 
 
 		 625 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  24.12 
 
 		 624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.4 
 
 		 605 aa  173  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  23.82 
 
 		 626 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  24.53 
 
 		 625 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  23.85 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  24.56 
 
 		 606 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  24.56 
 
 		 606 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  23.95 
 
 		 626 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.49 
 
 		 639 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  24.32 
 
 		 633 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  24.87 
 
 		 614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  23.8 
 
 		 629 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  23.96 
 
 		 639 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 635 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  23.41 
 
 		 637 aa  164  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  24.51 
 
 		 629 aa  163  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.8 
 
 		 650 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  22.95 
 
 		 641 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  21.95 
 
 		 627 aa  160  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  25.04 
 
 		 625 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  28.25 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.72 
 
 		 660 aa  159  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  24.74 
 
 		 606 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  22.43 
 
 		 648 aa  157  6e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.66 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  25.78 
 
 		 623 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0090  CBS signal-transduction protein  24.91 
 
 		 629 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.382061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  24.32 
 
 		 642 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  23.27 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  23.91 
 
 		 645 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  24.78 
 
 		 645 aa  153  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  21.1 
 
 		 629 aa  153  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  26.47 
 
 		 613 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  25.57 
 
 		 601 aa  150  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 		 603 aa  150  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  25.75 
 
 		 641 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  22.51 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2028  signal-transduction protein  27.03 
 
 		 481 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.66 
 
 		 649 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  25.22 
 
 		 645 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26 
 
 		 667 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.35 
 
 		 648 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  23.09 
 
 		 645 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  22.76 
 
 		 645 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.4 
 
 		 601 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.54 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  24.84 
 
 		 628 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.24 
 
 		 601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  23.79 
 
 		 600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  25.44 
 
 		 603 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.45 
 
 		 603 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.37 
 
 		 603 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  24.96 
 
 		 615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  22.72 
 
 		 663 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  23.35 
 
 		 646 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  22.43 
 
 		 645 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0471  nucleotidyltransferase, putative  24 
 
 		 622 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.67 
 
 		 636 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  26.19 
 
 		 601 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  25.05 
 
 		 644 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  21.77 
 
 		 638 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3348  putative nucleotidyltransferase  26.01 
 
 		 646 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.351645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.96 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.59 
 
 		 478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  21.59 
 
 		 643 aa  128  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.68 
 
 		 606 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 		 603 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  26.23 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>