230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2004 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2004  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
622 aa  1247    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.429129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1900  cyclic nucleotide-binding protein  54.74 
 
 
640 aa  669    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0670  cyclic nucleotide-binding protein  43.87 
 
 
625 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.13 
 
 
633 aa  205  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  26.07 
 
 
641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.77 
 
 
637 aa  188  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  26.2 
 
 
634 aa  187  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2056  signal-transduction protein  30.33 
 
 
485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.120352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.12 
 
 
644 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.46 
 
 
605 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  26.75 
 
 
603 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  28.29 
 
 
642 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.03 
 
 
622 aa  176  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  23.5 
 
 
624 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  25.2 
 
 
629 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  27.32 
 
 
606 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.64 
 
 
626 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.98 
 
 
606 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
606 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.24 
 
 
629 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  24.18 
 
 
618 aa  169  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 
606 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.35 
 
 
660 aa  163  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  24.42 
 
 
624 aa  163  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  26.08 
 
 
645 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  24.06 
 
 
626 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  26.03 
 
 
614 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  24.1 
 
 
615 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  26.67 
 
 
641 aa  161  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  27.38 
 
 
623 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  26.53 
 
 
615 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  29.13 
 
 
486 aa  160  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.53 
 
 
615 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  26.53 
 
 
615 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  26.53 
 
 
615 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  23.16 
 
 
625 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  26.97 
 
 
615 aa  157  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  25.16 
 
 
627 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  28.11 
 
 
625 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  27.75 
 
 
645 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  23.15 
 
 
629 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.37 
 
 
601 aa  153  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  24.59 
 
 
639 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.89 
 
 
635 aa  153  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 
620 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  22.56 
 
 
625 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  26.23 
 
 
620 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  26.51 
 
 
633 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
623 aa  150  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.05 
 
 
600 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  26.91 
 
 
646 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  24.41 
 
 
629 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.67 
 
 
613 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.85 
 
 
649 aa  146  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  28.66 
 
 
615 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.61 
 
 
620 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.61 
 
 
620 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  24.03 
 
 
615 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 
628 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  24.84 
 
 
663 aa  144  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
615 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  24.44 
 
 
637 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  22.73 
 
 
611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2005  protein of unknown function DUF294, nucleotidyltransferase putative  34.06 
 
 
375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.469431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  24.45 
 
 
615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  20.75 
 
 
639 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  27.45 
 
 
574 aa  140  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  25.26 
 
 
615 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.55 
 
 
606 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.66 
 
 
478 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.77 
 
 
649 aa  138  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.34 
 
 
636 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.48 
 
 
650 aa  137  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  23.67 
 
 
626 aa  137  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1453  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.05 
 
 
604 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  23.15 
 
 
638 aa  136  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  27.03 
 
 
480 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.85 
 
 
601 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28 
 
 
667 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  22.57 
 
 
648 aa  134  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1394  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.42 
 
 
485 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.332611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.07 
 
 
603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.95 
 
 
603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0827  protein of unknown function DUF294 nucleotidyltransferase putative  26.93 
 
 
601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000971693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.64 
 
 
601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.67 
 
 
648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 
613 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.78 
 
 
603 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  29.98 
 
 
603 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0634  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.67 
 
 
604 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0507059  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2831  putative nucleotidyltransferases  22.6 
 
 
610 aa  126  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4702  cyclic nucleotide-binding/CBS:putative nucleotidyltransferase  25.11 
 
 
644 aa  125  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  25.26 
 
 
645 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  23.82 
 
 
615 aa  123  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1863  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.42 
 
 
625 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0994673  normal  0.46863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 
608 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2622  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.27 
 
 
603 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
645 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>