279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3086 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2502  cyclic nucleotide-binding protein  67.94 
 
 
607 aa  772    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2465  cyclic nucleotide-binding protein  68.11 
 
 
607 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3086  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
615 aa  1203    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.238532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2510  cyclic nucleotide-binding protein  68.11 
 
 
607 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.514462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1742  cyclic nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
626 aa  369  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.550637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2165  hypothetical protein  39.04 
 
 
490 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1589  putative signal transduction protein with CBS domains  34 
 
 
626 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0430994  normal  0.447949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
623 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2007  CBS domain-containing protein  29.19 
 
 
623 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232416  decreased coverage  0.00139706 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1296  hypothetical protein  27.91 
 
 
601 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.922257  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3713  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.76 
 
 
613 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000235103  unclonable  0.0000000288509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.72 
 
 
606 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0770  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.05 
 
 
603 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.461269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0822  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.05 
 
 
603 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 
615 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  27.72 
 
 
603 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.410169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3158  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.06 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.664732  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2113  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  29.15 
 
 
644 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 
606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  24.48 
 
 
641 aa  164  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  24.02 
 
 
627 aa  163  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  26.7 
 
 
606 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  24.32 
 
 
629 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0769  hypothetical protein  29.98 
 
 
574 aa  161  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463827  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3695  cyclic nucleotide-binding protein  29.97 
 
 
603 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  26.86 
 
 
606 aa  160  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  24.8 
 
 
629 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  24.2 
 
 
626 aa  159  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3836  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.52 
 
 
601 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3824  CBS domain-containing protein  29.42 
 
 
605 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664828 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0554  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.79 
 
 
637 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3753  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.52 
 
 
601 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  26.39 
 
 
624 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 
606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 
620 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  25.08 
 
 
625 aa  154  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  24.96 
 
 
620 aa  154  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 
624 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  24.92 
 
 
615 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.31 
 
 
618 aa  153  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  24.92 
 
 
615 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 
620 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  25.12 
 
 
620 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  24.92 
 
 
615 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3142  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
608 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  24.75 
 
 
615 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3274  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.47 
 
 
596 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.877425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  24.27 
 
 
626 aa  150  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  23.66 
 
 
625 aa  150  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  23.79 
 
 
629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0629  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.26 
 
 
667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  24.87 
 
 
615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  24.92 
 
 
615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  26.34 
 
 
603 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  24.24 
 
 
637 aa  146  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  24.36 
 
 
626 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  25.59 
 
 
614 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  25.73 
 
 
615 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1866  cyclic nucleotide-binding protein  27.92 
 
 
615 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450839  normal  0.446941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  26.48 
 
 
618 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4543  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 
639 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.661781  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2583  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.88 
 
 
648 aa  143  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  24.96 
 
 
628 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3143  CBS domain-containing protein  30.79 
 
 
601 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1635  cyclic nucleotide-binding/CBS/putative nucleotidyltransferase  24.53 
 
 
646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.5663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  25.9 
 
 
636 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
629 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0302  signal-transduction protein  23.41 
 
 
648 aa  140  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  24.3 
 
 
622 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 
615 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2480  CBS domain-containing protein  23.49 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 
625 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 
615 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0817  CBS domain-containing protein  28.24 
 
 
603 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.175091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.98 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0978  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
635 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.082367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0380  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
645 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.488205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0354  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.466174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4848  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.602391  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3825  CBS domain-containing protein  28.09 
 
 
598 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4030  CBS domain-containing protein  26.87 
 
 
641 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210383  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4152  signal-transduction protein  28.03 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.729428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0903  cyclic nucleotide-binding protein  26.24 
 
 
638 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3131  cyclic nucleotide-binding domain (cNMP-BD) protein  24.2 
 
 
633 aa  130  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  26.35 
 
 
605 aa  127  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  26 
 
 
643 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1025  cyclic nucleotide-binding protein  25.33 
 
 
645 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  25.27 
 
 
480 aa  125  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2052  cyclic nucleotide-binding protein  26.22 
 
 
663 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.19282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  23.22 
 
 
613 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2478  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  23.86 
 
 
642 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05910  cyclic nucleotide-binding protein  25.96 
 
 
645 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0914238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0382  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 
645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.263171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1266  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.08 
 
 
649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  23.32 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5185  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  25.53 
 
 
646 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255954  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1034  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  22.89 
 
 
660 aa  117  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1543  putative signal-transduction protein with CBS domains  20 
 
 
600 aa  117  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00292919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  25.41 
 
 
633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1304  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  23.85 
 
 
650 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333083  normal  0.600467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>