45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3745 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3745  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 167 aa  334  3.9999999999999995e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0517034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  38.66 
 
 		 462 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  33.95 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  37.82 
 
 		 462 aa  71.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1505  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.331572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  23.68 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.58 
 
 		 503 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4022  cyclic nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  27.03 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 228 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0306  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.45 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 230 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  28.79 
 
 		 254 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 227 aa  47.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1182  cyclic nucleotide-binding protein  25.87 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  0.0489363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  31.37 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.28 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  31.37 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.66 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.47 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  25.95 
 
 		 563 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  24.24 
 
 		 357 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 507 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  26.72 
 
 		 747 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  23.78 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  28.92 
 
 		 388 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 239 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.46 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 221 aa  41.2  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.78 
 
 		 322 aa  41.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.81 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  24.37 
 
 		 388 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.66 
 
 		 238 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  24.18 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 413 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>