192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2053 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  95.42 
 
 		 153 aa  295  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.23 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  31.82 
 
 		 1048 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  25.55 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  30 
 
 		 1065 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.59 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.09 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  23.93 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10073  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0512571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  29.31 
 
 		 563 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  33.68 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 495 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  30.63 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  24.64 
 
 		 583 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  31.25 
 
 		 482 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1527  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000128576  hitchhiker  0.00383137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  27.42 
 
 		 739 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  27.01 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  23.93 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  29.73 
 
 		 225 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.87 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  27.34 
 
 		 381 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  27.59 
 
 		 412 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1873  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222244  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  22.41 
 
 		 454 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  26.24 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.73 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.14 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 410 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.93 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  24.32 
 
 		 236 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  30.1 
 
 		 598 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  25.37 
 
 		 1017 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.82 
 
 		 1056 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 408 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  20.44 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  23.85 
 
 		 412 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.57 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.4 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 		 426 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  27.52 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  26.09 
 
 		 729 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  22.88 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  30.23 
 
 		 241 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.06 
 
 		 413 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  24.84 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 		 1075 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  24.77 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  20.44 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.86 
 
 		 408 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  24.49 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  27.66 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.52 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  25.23 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  29.07 
 
 		 482 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04006  cAMP-regulatory protein  27.14 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  24.76 
 
 		 738 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.81 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 		 584 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>