104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1873 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1873  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2686  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.32 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.640376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.65 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1978  cyclic nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2344  cyclic nucleotide-binding domain protein  38.75 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  34.41 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  32.2 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  25.55 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 		 357 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 563 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 512 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  27.37 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  26.36 
 
 		 621 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  26.28 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 		 454 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 417 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 		 482 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.97 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.55 
 
 		 503 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  26.42 
 
 		 263 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  27.48 
 
 		 747 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 		 584 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2515  cyclic nucleotide-binding  32.56 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.75 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  31.51 
 
 		 482 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  24.39 
 
 		 570 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  23.66 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.31 
 
 		 487 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  27.72 
 
 		 1408 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 419 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  28.21 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.46 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.97 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 435 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  20.93 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.97 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 		 214 aa  43.9  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.58 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  38.16 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  19.57 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  22.93 
 
 		 1018 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  32.88 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0873  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 605 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.563434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1065 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  26.44 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  24.63 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  30.99 
 
 		 426 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  24.63 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  26.44 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.15 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  26.44 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  29.55 
 
 		 412 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 367 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 225 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  28.4 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  20.29 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  20.35 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  18.84 
 
 		 194 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  30.68 
 
 		 425 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.68 
 
 		 425 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 		 225 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  30.14 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  24.72 
 
 		 801 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  25.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  30.14 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  25.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  25.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  24.18 
 
 		 738 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  23.88 
 
 		 734 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  25.66 
 
 		 210 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  25.26 
 
 		 739 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 		 224 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 221 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1527  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.8 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000128576  hitchhiker  0.00383137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2540  cyclic nucleotide binding regulatory protein  21.74 
 
 		 211 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.90473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  25.66 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  18.92 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.82 
 
 		 226 aa  40.8  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>