134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1978 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1978  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2344  cyclic nucleotide-binding domain protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2686  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.87 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.640376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.41 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.76 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1873  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.75 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222244  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 		 322 aa  67  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.74 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  29.46 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1292  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  26.61 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  37.21 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 		 251 aa  50.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  25.17 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  28.78 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5297  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.81 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  22.68 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  24.66 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  26.13 
 
 		 621 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 224 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 225 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  23.89 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.27 
 
 		 228 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  31.73 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  38.6 
 
 		 231 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 		 228 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.78 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.89 
 
 		 225 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 226 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  26.98 
 
 		 226 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 		 230 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  47.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.36 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.12 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.43 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  34.52 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.2 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 415 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  27.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  26.9 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10073  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  36.59 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0512571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  24.43 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1392  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 		 577 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  23.2 
 
 		 570 aa  45.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  21.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 230 aa  44.3  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 		 219 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 228 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  29.09 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  22.95 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  24.34 
 
 		 462 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.8 
 
 		 575 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  22.79 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  32.53 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  32.41 
 
 		 426 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.76 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  23.53 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.31 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 214 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  23.28 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 232 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.73 
 
 		 239 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  24.09 
 
 		 563 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.55 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>