62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0760 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2686  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  75.48 
 
 		 161 aa  245  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.640376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1978  cyclic nucleotide-binding protein  48.41 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2344  cyclic nucleotide-binding domain protein  48.41 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1127  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.54 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.871772  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1873  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.65 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30.47 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.51 
 
 		 286 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.48 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  32.2 
 
 		 482 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  24.43 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.92 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 		 570 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.16 
 
 		 225 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 251 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 		 225 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  25.19 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.2 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 435 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.68 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  28.89 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  23.26 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.36 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 225 aa  44.3  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 832 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1292  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.68 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 		 729 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.75 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.85 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.41 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  27.83 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.42 
 
 		 179 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  25.86 
 
 		 1040 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 		 419 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  29.47 
 
 		 577 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 472 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  24.03 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.22 
 
 		 228 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 232 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  23.02 
 
 		 482 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1527  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000128576  hitchhiker  0.00383137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 		 369 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  23.91 
 
 		 417 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  27.78 
 
 		 1048 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  24.39 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0028  cyclic nucleotide-binding protein  19.81 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  23.53 
 
 		 563 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.92 
 
 		 225 aa  40.8  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 426 aa  40.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.39 
 
 		 226 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>