240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4790 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  66.47 
 
 		 173 aa  234  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  65.88 
 
 		 177 aa  233  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6054  cyclic nucleotide-binding protein  64.47 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  57.89 
 
 		 163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  44.71 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5297  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.77 
 
 		 154 aa  141  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  37.58 
 
 		 155 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  36.91 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  33.08 
 
 		 739 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  34.51 
 
 		 425 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.51 
 
 		 425 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  29.51 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  28.68 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  27.45 
 
 		 721 aa  58.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  31.3 
 
 		 734 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.65 
 
 		 563 aa  57.4  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  28.29 
 
 		 1053 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  36.04 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.42 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  29.63 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  26.47 
 
 		 721 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.13 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  34.48 
 
 		 731 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.25 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.68 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  34.58 
 
 		 749 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  31.72 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  30.48 
 
 		 747 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  31.9 
 
 		 350 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  34.62 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.71 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  36 
 
 		 216 aa  51.6  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 226 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.4 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  34.65 
 
 		 210 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 412 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  30.63 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30 
 
 		 322 aa  51.2  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  30.36 
 
 		 214 aa  51.2  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1866  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.66 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 		 237 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  29.13 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  29.73 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.23 
 
 		 597 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.84 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  34.19 
 
 		 577 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  29.73 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  31.53 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  30.56 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  30.7 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 503 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  35.87 
 
 		 419 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  30.56 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  35.63 
 
 		 367 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  32.5 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  32.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.91 
 
 		 275 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  40.24 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  30.19 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.13 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  31.3 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  34.02 
 
 		 1048 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  31.68 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 238 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>