160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4796 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  57.98 
 
 		 265 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  58.37 
 
 		 265 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  56.42 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  35.51 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.04 
 
 		 425 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  38.04 
 
 		 425 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 		 149 aa  62  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  29.25 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  35.79 
 
 		 832 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  35.64 
 
 		 811 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  35.79 
 
 		 832 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 		 832 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  25.49 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.81 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.2 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1482  hypothetical protein  33.65 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1501  hypothetical protein  29.08 
 
 		 401 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.53 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  29.09 
 
 		 154 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 		 594 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 624 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  28.18 
 
 		 570 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 146 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  28.3 
 
 		 621 aa  52.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 		 212 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.61 
 
 		 644 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  23.76 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.04 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 		 563 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  30.84 
 
 		 155 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 721 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  29.52 
 
 		 124 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  27.37 
 
 		 449 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 		 367 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.15 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.26 
 
 		 322 aa  49.3  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 		 155 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  25.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  26.5 
 
 		 156 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 512 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 164 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  22.69 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  25.85 
 
 		 435 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  25.71 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  26.32 
 
 		 721 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  34.95 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24 
 
 		 122 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.04 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1873  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  26.62 
 
 		 772 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1100  cyclic nucleotide-binding protein  32.04 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.327334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  37.35 
 
 		 504 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  30.59 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.16 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.36 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  25.51 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  30.84 
 
 		 132 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.1 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.48 
 
 		 858 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  29.29 
 
 		 584 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0420  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 127 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.28 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 		 157 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 233 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5650  cyclic nucleotide-binding  28.97 
 
 		 300 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 237 aa  45.4  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 1075 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>