More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3546 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.46 
 
 		 127 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  37.61 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  36.61 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.3 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  33.02 
 
 		 563 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.62 
 
 		 228 aa  67  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  33.04 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  34.19 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 419 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  32.35 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 417 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  28.69 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  30.47 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  26.45 
 
 		 407 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  31.37 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.13 
 
 		 413 aa  57.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  28.69 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 598 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 		 570 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.98 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.7 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.06 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  28.45 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  27.59 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  28.16 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  27.59 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  27.87 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.62 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 424 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  24.07 
 
 		 1017 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  27.87 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  29.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  32.48 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  27.87 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.55 
 
 		 1075 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  32.63 
 
 		 1048 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.77 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  27.05 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>