153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2645 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
123 aa  249  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.3 
 
 
127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  61.48 
 
 
127 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  53.72 
 
 
132 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.41 
 
 
122 aa  136  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  48.78 
 
 
122 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  49.58 
 
 
119 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.98 
 
 
131 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.26 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.4 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  35.04 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.13 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 
219 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
265 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  28.85 
 
 
265 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  27.88 
 
 
265 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  23.62 
 
 
413 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.77 
 
 
238 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.96 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.55 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 
563 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  23.08 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.93 
 
 
226 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
225 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.32 
 
 
644 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.73 
 
 
224 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
226 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  28.43 
 
 
454 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  31.91 
 
 
412 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  30.85 
 
 
322 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 
570 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0335  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.38 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
215 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.44 
 
 
231 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
388 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  28.3 
 
 
224 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
227 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  34.78 
 
 
738 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3615  cyclic nucleotide-binding protein  39.02 
 
 
412 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 
215 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5468  cyclic nucleotide-binding protein  39.02 
 
 
427 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.907492  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 
435 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  27.08 
 
 
425 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 
425 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 
346 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.63 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
236 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.03 
 
 
224 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
228 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2360  cyclic nucleotide-binding protein  37.84 
 
 
414 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.85 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
232 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25.62 
 
 
217 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  25.96 
 
 
222 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3788  cyclic nucleotide-binding protein  37.84 
 
 
416 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.32626  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.44 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  23.53 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4631  cyclic nucleotide-binding protein  36.49 
 
 
416 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0942105  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3733  cyclic nucleotide-binding protein  36.49 
 
 
416 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0188297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5000  cyclic nucleotide-binding protein  37.84 
 
 
413 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.990165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
226 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2437  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  30 
 
 
179 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.719613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3331  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
258 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.94 
 
 
226 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.76 
 
 
212 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  27.96 
 
 
409 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  41.89 
 
 
414 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  31.08 
 
 
512 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  22.94 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
224 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0150  ribonuclease BN-like family protein  33.33 
 
 
435 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  25.83 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  19.8 
 
 
428 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1377  cyclic nucleotide-binding protein  40.54 
 
 
411 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.826586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  24.3 
 
 
215 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
248 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0046  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.4 
 
 
605 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
226 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  22.02 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
860 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  22.02 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0420  cyclic nucleotide-binding protein  28.72 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>