214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1194 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
127 aa  262  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  98.43 
 
 
127 aa  258  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  62.3 
 
 
123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  56.56 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  56.1 
 
 
122 aa  149  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  48.33 
 
 
122 aa  127  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  49.17 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  48.74 
 
 
119 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.09 
 
 
145 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.46 
 
 
127 aa  100  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  38.46 
 
 
124 aa  93.6  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 
413 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.47 
 
 
219 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.78 
 
 
243 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  30.28 
 
 
265 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
563 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  29.36 
 
 
265 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 
265 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 
425 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.08 
 
 
224 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.65 
 
 
425 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.97 
 
 
644 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.14 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
225 aa  54.7  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.68 
 
 
226 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  30.19 
 
 
435 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 
228 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
252 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0150  ribonuclease BN-like family protein  42.11 
 
 
435 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
236 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 
419 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.83 
 
 
238 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
236 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 
454 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
225 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.64 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.7 
 
 
225 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
229 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 
244 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
231 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
503 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  32.41 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.4 
 
 
248 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
229 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
417 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 
228 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  27.74 
 
 
923 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 
1056 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3331  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  34.55 
 
 
388 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.68 
 
 
570 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  30 
 
 
528 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
241 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  29.91 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  36.11 
 
 
241 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  30.85 
 
 
412 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
230 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
226 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.68 
 
 
226 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 
236 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
236 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 
512 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.52 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  27.27 
 
 
263 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  30 
 
 
222 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  31.91 
 
 
449 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  27.27 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 
482 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
1075 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0102  cyclic nucleotide-binding protein  24.17 
 
 
430 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  23.66 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  29.91 
 
 
224 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
225 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
211 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
226 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
225 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
231 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1377  cyclic nucleotide-binding protein  37.8 
 
 
411 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.826586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
227 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 
414 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  38.67 
 
 
948 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
247 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
220 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
236 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.73 
 
 
243 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.35 
 
 
226 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.83 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
224 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>