71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0102 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0102  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 430 aa  890    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0241  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1537  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.376192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2442  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0195  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  37.04 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2440  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  31.16 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0146684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.11 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4510  response regulator receiver domain-containing protein  30.71 
 
 		 310 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.078722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  30.3 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0803521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  30.61 
 
 		 154 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0110  response regulator receiver  27.5 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1112  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 160 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 148 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.85 
 
 		 225 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  31.91 
 
 		 577 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2151  hypothetical protein  27.34 
 
 		 215 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 231 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  30.47 
 
 		 860 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 		 226 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.98 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000366193  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 		 155 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  22.86 
 
 		 124 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  37.5 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  24.84 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 		 149 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4028  Thioredoxin-disulfide reductase  25 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0134605  normal  0.10391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  26.73 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  27 
 
 		 581 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  21.36 
 
 		 286 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.23 
 
 		 225 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.17 
 
 		 127 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000260717  hitchhiker  0.000176219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  24.14 
 
 		 127 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2490  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 143 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.529165  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 155 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2527  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 143 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.122265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 228 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2535  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 143 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.187626  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  23.58 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 151 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  27.03 
 
 		 265 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.14 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0401  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.18 
 
 		 144 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  33.71 
 
 		 147 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  27.55 
 
 		 583 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 242 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  26.73 
 
 		 215 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 		 598 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 858 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  35.44 
 
 		 237 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2761  response regulator receiver  20.37 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 146 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 801 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  32.91 
 
 		 355 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0141  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 160 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 		 157 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  25.21 
 
 		 265 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>