103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0706 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.46 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  39.84 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  38.4 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  42.16 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.59 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  31.93 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 		 563 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 238 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.46 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 236 aa  50.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 236 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 219 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.15 
 
 		 226 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.06 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0866  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.26 
 
 		 546 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 413 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  35.05 
 
 		 435 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  32.26 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 		 225 aa  47.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 226 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  27.03 
 
 		 155 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 250 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 		 222 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  26.83 
 
 		 738 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  31.87 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  25.83 
 
 		 226 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0916  cAMP-dependent protein - catabolite gene activator and regulatory subunit  26.61 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.25 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 224 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  30.1 
 
 		 353 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  24.14 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.93 
 
 		 503 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.97 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  26.36 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  25.74 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 233 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  30.17 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.16 
 
 		 224 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  34.94 
 
 		 376 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  28.16 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 173 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  27.59 
 
 		 407 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 222 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 228 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 		 577 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 237 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  31.33 
 
 		 241 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  30.77 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 		 224 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  22.22 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  28.57 
 
 		 261 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.23 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.34 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  25.47 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.97 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0335  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0190  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 346 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0274907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 215 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0657  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418671  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.75 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 243 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>