228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1254 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1254  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1957  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  57.26 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.17 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  49.17 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  42.98 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0972  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0589137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1436  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 122 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2573  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1494  cyclic nucleotide-binding protein  47.9 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00548568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0706  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  38.24 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  32.38 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 219 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 425 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 		 425 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.64 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  32.59 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 563 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.61 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  31.3 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.46 
 
 		 1056 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 435 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4053  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 211 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.79 
 
 		 1075 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  28.8 
 
 		 570 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4231  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 220 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 		 243 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.01 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 227 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  29.81 
 
 		 265 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2592  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.235726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.91 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0691  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.65 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.275069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 		 222 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 227 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0067  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 415 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  33.91 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 225 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  35 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 644 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  28.16 
 
 		 211 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 		 251 aa  47.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_002620  TC0506  cyclic nucleotide-binding protein, putative  31.07 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.191962  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  36 
 
 		 241 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 		 224 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3912  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.9 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 210 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  27.45 
 
 		 210 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  36.08 
 
 		 409 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  34.55 
 
 		 731 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.13 
 
 		 238 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 417 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  26.21 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 228 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.68 
 
 		 248 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  27.27 
 
 		 265 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  27.18 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  26.21 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>