217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1179 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1179  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0235  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.79 
 
 
171 aa  174  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.742856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0236  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.81 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.754806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.67 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25.77 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 
226 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0097  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 
329 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.61 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.77 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.68 
 
 
224 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.26 
 
 
225 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.8 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3707  hypothetical protein  28.79 
 
 
563 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3442  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.79 
 
 
563 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352677  normal  0.0673657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.43 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.72 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  31.86 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.25 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  25.71 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.36 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  36.67 
 
 
575 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  32.14 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.41 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.21 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.26 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  23.39 
 
 
267 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 
224 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.98 
 
 
154 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 
223 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.68 
 
 
228 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 
1056 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
230 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 
495 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.21 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.41 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.47 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.51 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.48 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.18 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  27.88 
 
 
729 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.43 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  25.69 
 
 
1177 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.85 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  27.36 
 
 
388 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
241 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  25 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4840  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.37 
 
 
538 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.572227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  31.63 
 
 
425 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  33.65 
 
 
605 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 
425 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
603 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4364  thioredoxin-disulfide reductase  25.37 
 
 
538 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.15 
 
 
254 aa  48.9  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  24.58 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 
129 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25.45 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2616  cyclic nucleotide-binding protein  30.3 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.61 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.03 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  29.85 
 
 
407 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>