112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0304 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0304  fibronectin, type III  100 
 
 
279 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0326  Fibronectin type III domain protein  85.28 
 
 
231 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0315  Fibronectin type III domain protein  85.28 
 
 
231 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  49.72 
 
 
680 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.71 
 
 
456 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.78 
 
 
455 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.78 
 
 
455 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.9 
 
 
455 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.14 
 
 
455 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.78 
 
 
455 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.14 
 
 
455 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.65 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.84 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.21 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  32.53 
 
 
2170 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  31.67 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.09 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.65 
 
 
455 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  32.95 
 
 
743 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  31.55 
 
 
762 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  30.51 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.71 
 
 
6885 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  32.28 
 
 
1887 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  30.51 
 
 
458 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  26.34 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  34.09 
 
 
973 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  30.28 
 
 
2334 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  36.17 
 
 
749 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  42 
 
 
997 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  30.86 
 
 
997 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  42.27 
 
 
978 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.48 
 
 
655 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  37.65 
 
 
660 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  40.8 
 
 
1462 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  43.48 
 
 
900 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  36 
 
 
729 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  32.97 
 
 
1221 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.86 
 
 
854 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.86 
 
 
847 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.32 
 
 
809 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  27.41 
 
 
2286 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.04 
 
 
649 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.96 
 
 
1448 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  42.67 
 
 
608 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  29.17 
 
 
803 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.15 
 
 
703 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.71 
 
 
480 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 
1121 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  28.27 
 
 
1160 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.54 
 
 
438 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 
658 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  36.96 
 
 
614 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  33.09 
 
 
385 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  30.3 
 
 
787 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  26.34 
 
 
464 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 
544 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  28.65 
 
 
561 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  37.21 
 
 
1139 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  26.32 
 
 
465 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  32.99 
 
 
1154 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.09 
 
 
543 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  35.64 
 
 
924 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  33.54 
 
 
445 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  33.68 
 
 
637 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  31.13 
 
 
3802 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
1209 aa  49.7  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 
1050 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 
1137 aa  49.3  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  31.5 
 
 
651 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  39.44 
 
 
1298 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  37.39 
 
 
1141 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.27 
 
 
1628 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  33.96 
 
 
552 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  40.96 
 
 
681 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  34.02 
 
 
768 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  35 
 
 
523 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  33.33 
 
 
1017 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  31.69 
 
 
484 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  25.95 
 
 
598 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  32.59 
 
 
1007 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.9 
 
 
998 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  38.37 
 
 
1597 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  40.23 
 
 
562 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  23.76 
 
 
1199 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  27.59 
 
 
674 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  27.59 
 
 
674 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  27.59 
 
 
674 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.69 
 
 
3278 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  35.29 
 
 
652 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  27.59 
 
 
674 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  35.87 
 
 
938 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  27.59 
 
 
674 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  26.6 
 
 
1238 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  33.33 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  30.11 
 
 
667 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 
674 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  26.23 
 
 
674 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  36.17 
 
 
429 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25.58 
 
 
648 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.97 
 
 
12684 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>