124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3580 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  53.91 
 
 		 688 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  54.06 
 
 		 687 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  54.3 
 
 		 687 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  64.3 
 
 		 756 aa  957    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  64.3 
 
 		 756 aa  957    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  62.77 
 
 		 752 aa  947    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  64.3 
 
 		 756 aa  957    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  63.29 
 
 		 744 aa  947    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  53.91 
 
 		 688 aa  724    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  61.55 
 
 		 774 aa  886    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  53.03 
 
 		 688 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  53.91 
 
 		 688 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  52.08 
 
 		 687 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  65.78 
 
 		 758 aa  1028    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  100 
 
 		 764 aa  1565    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  42.44 
 
 		 717 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  29.63 
 
 		 855 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  29.1 
 
 		 731 aa  223  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1082 aa  210  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  25.41 
 
 		 736 aa  158  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  23.13 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  23.13 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  23.13 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  22.86 
 
 		 1109 aa  58.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  23.38 
 
 		 1099 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  26.07 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  25.24 
 
 		 964 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  23.08 
 
 		 1142 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  23.81 
 
 		 559 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  25.65 
 
 		 553 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  23.31 
 
 		 1088 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  22.63 
 
 		 1112 aa  54.3  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  24.4 
 
 		 548 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  23.54 
 
 		 563 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  23.56 
 
 		 554 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  23.19 
 
 		 540 aa  52.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.14 
 
 		 1088 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.14 
 
 		 1088 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 554 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  22.4 
 
 		 1100 aa  51.2  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  22.73 
 
 		 1094 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  22.48 
 
 		 1088 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  23.37 
 
 		 568 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  22.77 
 
 		 544 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  25.48 
 
 		 553 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  22.4 
 
 		 1100 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.38 
 
 		 538 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  23.9 
 
 		 593 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  23.98 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  23.62 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  22.61 
 
 		 525 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  25.48 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  22.26 
 
 		 600 aa  50.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  25.25 
 
 		 1098 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  20.91 
 
 		 560 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  22.37 
 
 		 564 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  26.29 
 
 		 558 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  22.54 
 
 		 551 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  23.39 
 
 		 535 aa  48.5  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  24.58 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  24.58 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.89 
 
 		 562 aa  48.9  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  24.58 
 
 		 596 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  23.17 
 
 		 538 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  21.23 
 
 		 560 aa  48.5  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  23.17 
 
 		 574 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  23.13 
 
 		 605 aa  47.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  23.26 
 
 		 1098 aa  47.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  24.71 
 
 		 534 aa  47.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  24.53 
 
 		 572 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  22.66 
 
 		 542 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  22.61 
 
 		 553 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  21.63 
 
 		 553 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 609 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 576 aa  47.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  24.83 
 
 		 576 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  24.52 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  24 
 
 		 574 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  23.55 
 
 		 639 aa  46.2  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22590  glycosidase  22.67 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  24.89 
 
 		 1106 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  21.93 
 
 		 532 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  22.78 
 
 		 1088 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3325  alpha amylase catalytic region  21.83 
 
 		 556 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  22.91 
 
 		 538 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  20.65 
 
 		 1130 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  24.91 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  24.44 
 
 		 1106 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  23.39 
 
 		 536 aa  46.2  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  20.16 
 
 		 535 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  25.58 
 
 		 1121 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  25.5 
 
 		 1134 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  22.51 
 
 		 555 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  24.44 
 
 		 1106 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  23.25 
 
 		 598 aa  45.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7974  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 547 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  21.77 
 
 		 533 aa  45.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  31.09 
 
 		 651 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  24.8 
 
 		 546 aa  45.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>