29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2736 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  98.11 
 
 		 687 aa  1378    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  100 
 
 		 687 aa  1400    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  52.43 
 
 		 758 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  54.79 
 
 		 756 aa  749    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  54.79 
 
 		 756 aa  749    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  54.47 
 
 		 752 aa  755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  54.3 
 
 		 764 aa  740    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  54.79 
 
 		 756 aa  750    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  54.57 
 
 		 744 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  67.54 
 
 		 687 aa  970    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  73.25 
 
 		 688 aa  1055    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  73.54 
 
 		 688 aa  1051    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  55.52 
 
 		 774 aa  757    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  73.25 
 
 		 688 aa  1054    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  73.1 
 
 		 688 aa  1051    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  41.75 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  30.38 
 
 		 855 aa  250  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  27.3 
 
 		 731 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1082 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  24.77 
 
 		 736 aa  127  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  29.72 
 
 		 964 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 		 548 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  22.32 
 
 		 544 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 554 aa  45.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  23.87 
 
 		 553 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 553 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>