28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7407 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  67.69 
 
 		 687 aa  967    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  52.51 
 
 		 758 aa  717    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  52.08 
 
 		 764 aa  721    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  100 
 
 		 687 aa  1412    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  65.2 
 
 		 688 aa  933    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  64.62 
 
 		 688 aa  929    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  54.64 
 
 		 774 aa  750    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  64.62 
 
 		 688 aa  932    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  52.5 
 
 		 744 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  53.61 
 
 		 756 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  52.65 
 
 		 752 aa  732    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  64.62 
 
 		 688 aa  931    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  53.76 
 
 		 756 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  53.76 
 
 		 756 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  67.54 
 
 		 687 aa  970    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  41.58 
 
 		 717 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  30.76 
 
 		 855 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1082 aa  216  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  27.86 
 
 		 731 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  25.74 
 
 		 736 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  22.22 
 
 		 646 aa  61.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  25.07 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  24.5 
 
 		 554 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  29.05 
 
 		 964 aa  47.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  24.57 
 
 		 559 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 554 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 		 559 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  25.32 
 
 		 559 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>