20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3114 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 1082 aa  2082    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  44.59 
 
 		 731 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  39.1 
 
 		 855 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  34.92 
 
 		 736 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  29.73 
 
 		 688 aa  254  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  30.21 
 
 		 688 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  29.79 
 
 		 688 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  29.86 
 
 		 688 aa  244  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  28.21 
 
 		 758 aa  235  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  28.79 
 
 		 687 aa  226  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  29.27 
 
 		 744 aa  223  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  28.07 
 
 		 687 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  28.02 
 
 		 687 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  26.71 
 
 		 717 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  28.96 
 
 		 752 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  29.43 
 
 		 756 aa  218  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  29.43 
 
 		 756 aa  218  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  29.28 
 
 		 756 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  26.52 
 
 		 764 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  28.64 
 
 		 774 aa  214  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>