131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0356 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  56.03 
 
 		 688 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  54.4 
 
 		 687 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  54.79 
 
 		 687 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  100 
 
 		 756 aa  1550    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  100 
 
 		 756 aa  1550    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  87.08 
 
 		 752 aa  1344    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  99.74 
 
 		 756 aa  1548    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  85.16 
 
 		 744 aa  1321    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  56.34 
 
 		 688 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  66.04 
 
 		 774 aa  938    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  56.03 
 
 		 688 aa  742    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  56.34 
 
 		 688 aa  751    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  53.76 
 
 		 687 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  59.49 
 
 		 758 aa  887    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  64.38 
 
 		 764 aa  957    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  41.7 
 
 		 717 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  30.51 
 
 		 855 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  29.69 
 
 		 731 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1082 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  25.22 
 
 		 736 aa  134  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  22.27 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  22.27 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  22.27 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  25.7 
 
 		 559 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 548 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  28.96 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 		 646 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  24.4 
 
 		 1109 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  26.28 
 
 		 553 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 554 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  26.54 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  23.64 
 
 		 1142 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  25.07 
 
 		 1121 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  25.93 
 
 		 964 aa  52  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  25.23 
 
 		 1099 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 553 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  26.39 
 
 		 1098 aa  51.6  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  29.26 
 
 		 1106 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  29.26 
 
 		 1106 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  29.26 
 
 		 1106 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  25.23 
 
 		 1100 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  25 
 
 		 553 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  25 
 
 		 572 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  26.38 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  24.62 
 
 		 1115 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2546  alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 561 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  23.81 
 
 		 605 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  24.03 
 
 		 558 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.61 
 
 		 1088 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 543 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.61 
 
 		 1088 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 563 aa  49.3  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.11 
 
 		 551 aa  49.3  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  24.14 
 
 		 1088 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  25.49 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  24.59 
 
 		 533 aa  48.9  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  25.68 
 
 		 511 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  28.82 
 
 		 1105 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  22.51 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3849  alpha amylase, catalytic region  25.99 
 
 		 554 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0257835 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 599 aa  48.5  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  27.11 
 
 		 551 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  25.08 
 
 		 1100 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  25.36 
 
 		 521 aa  48.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  24.08 
 
 		 553 aa  48.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.11 
 
 		 551 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  23.78 
 
 		 555 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  22.6 
 
 		 561 aa  47.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  22.45 
 
 		 579 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.46 
 
 		 550 aa  47.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.46 
 
 		 550 aa  47.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  27.11 
 
 		 551 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  27.11 
 
 		 551 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  25 
 
 		 572 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  21.05 
 
 		 556 aa  47  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  25.94 
 
 		 563 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  24.7 
 
 		 1101 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.11 
 
 		 551 aa  47.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  25.6 
 
 		 1101 aa  47  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  24.46 
 
 		 550 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.11 
 
 		 550 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  26.14 
 
 		 1110 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  27.06 
 
 		 1100 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  26.05 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  24.92 
 
 		 1088 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  26.72 
 
 		 1108 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  26.26 
 
 		 596 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  26.26 
 
 		 596 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.52 
 
 		 562 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5406  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  23.94 
 
 		 512 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  25.7 
 
 		 596 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  23.48 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.22 
 
 		 551 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  23.91 
 
 		 1061 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.67 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4720  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.67 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  26.67 
 
 		 551 aa  46.6  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>