More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0315 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  56.8 
 
 		 540 aa  655    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  71.2 
 
 		 554 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  65.04 
 
 		 554 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  55.43 
 
 		 541 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 555 aa  1149    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  72.83 
 
 		 554 aa  852    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  69.96 
 
 		 553 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  67.03 
 
 		 554 aa  788    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  68.48 
 
 		 553 aa  810    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  70.45 
 
 		 553 aa  829    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 579 aa  585  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  48.43 
 
 		 570 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  50.36 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  50 
 
 		 543 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 		 564 aa  537  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  49.18 
 
 		 556 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  46.07 
 
 		 558 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  46.78 
 
 		 521 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  48.01 
 
 		 548 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  46.03 
 
 		 552 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  45.12 
 
 		 548 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  47.34 
 
 		 559 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  46.36 
 
 		 559 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  47.09 
 
 		 563 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  46.18 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  46.18 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  44.55 
 
 		 548 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  45.14 
 
 		 1098 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  43.2 
 
 		 1093 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  43.2 
 
 		 1093 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  43.85 
 
 		 1061 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  42.2 
 
 		 1104 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  43.35 
 
 		 1100 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  42.39 
 
 		 1092 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  42.99 
 
 		 1085 aa  452  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  42.35 
 
 		 1094 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  44.1 
 
 		 1102 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  42.7 
 
 		 1088 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  41.83 
 
 		 606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  42.41 
 
 		 1121 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  44 
 
 		 1102 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  42.46 
 
 		 1088 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  43.09 
 
 		 601 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  42.52 
 
 		 1100 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  42.7 
 
 		 1088 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  44.02 
 
 		 1102 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  43.17 
 
 		 682 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  44.99 
 
 		 551 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  42.46 
 
 		 1088 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  43.38 
 
 		 1121 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  42.46 
 
 		 1088 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  41.65 
 
 		 610 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  43.85 
 
 		 1095 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  41.8 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  42.55 
 
 		 1160 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  42.36 
 
 		 1164 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  41.89 
 
 		 591 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  43.41 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  43.58 
 
 		 1110 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  43.65 
 
 		 1114 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  44.36 
 
 		 551 aa  438  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  41.65 
 
 		 567 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  42.36 
 
 		 1164 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  41.36 
 
 		 556 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  41.62 
 
 		 1154 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  45.02 
 
 		 1100 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  42.11 
 
 		 1099 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  43.94 
 
 		 1134 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  41.24 
 
 		 1088 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  40.67 
 
 		 1123 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  43.6 
 
 		 1113 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  43.47 
 
 		 588 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  41.39 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  41.36 
 
 		 1101 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  42.09 
 
 		 1106 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  40.88 
 
 		 1100 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  41.76 
 
 		 1098 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  40.93 
 
 		 562 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  44.69 
 
 		 1101 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  42.2 
 
 		 1154 aa  432  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  41.25 
 
 		 1152 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  41.5 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  42.6 
 
 		 571 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  41.73 
 
 		 1105 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  41.55 
 
 		 1106 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  41.55 
 
 		 1106 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  44.73 
 
 		 1131 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  41.14 
 
 		 574 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  40.89 
 
 		 1100 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  40.95 
 
 		 1112 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  44.93 
 
 		 1131 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  42.18 
 
 		 1130 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  41.41 
 
 		 556 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  44.93 
 
 		 1131 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  40.85 
 
 		 1115 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  40.44 
 
 		 1109 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  43.3 
 
 		 1131 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  43.3 
 
 		 1131 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  43.3 
 
 		 1131 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  42.2 
 
 		 1138 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>