78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3747 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  55.07 
 
 		 688 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  65.95 
 
 		 752 aa  969    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  66.13 
 
 		 756 aa  974    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  66.13 
 
 		 756 aa  976    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  64.52 
 
 		 744 aa  964    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  54.92 
 
 		 688 aa  754    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  55.21 
 
 		 688 aa  756    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  100 
 
 		 774 aa  1577    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  66.13 
 
 		 756 aa  974    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  54.77 
 
 		 688 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  54.64 
 
 		 687 aa  760    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  62.09 
 
 		 764 aa  919    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  59.7 
 
 		 758 aa  873    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  55.52 
 
 		 687 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  55.51 
 
 		 687 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  42.43 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  30.44 
 
 		 855 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  29.18 
 
 		 731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1082 aa  211  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  23.91 
 
 		 736 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  25.29 
 
 		 605 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  24.3 
 
 		 554 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.11 
 
 		 538 aa  54.7  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 544 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  23.97 
 
 		 563 aa  51.6  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  26.91 
 
 		 548 aa  51.2  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 544 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  24.76 
 
 		 562 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  24.85 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0412  alpha amylase, catalytic region  26.16 
 
 		 640 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  21.12 
 
 		 568 aa  48.9  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  32.29 
 
 		 576 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  21.78 
 
 		 646 aa  48.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  22.59 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  22.81 
 
 		 1101 aa  47.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  23.65 
 
 		 1100 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  24.51 
 
 		 599 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  22.66 
 
 		 1094 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  22.52 
 
 		 1088 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  25.07 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1323  alpha-amylase  26.97 
 
 		 604 aa  46.6  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  22.9 
 
 		 1142 aa  46.2  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  22.29 
 
 		 1099 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 555 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  26.17 
 
 		 553 aa  45.8  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  25.85 
 
 		 1164 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  23.19 
 
 		 570 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  25.85 
 
 		 1164 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  22.98 
 
 		 593 aa  45.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  26.59 
 
 		 544 aa  45.4  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  20.86 
 
 		 622 aa  45.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  27 
 
 		 1131 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  25.25 
 
 		 1137 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  27 
 
 		 1131 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  27 
 
 		 1131 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  27 
 
 		 1131 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  27 
 
 		 1131 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  25.91 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  24.24 
 
 		 1136 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  22.79 
 
 		 1100 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 559 aa  45.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12496  alpha-glucosidase aglA (maltase)  24.89 
 
 		 546 aa  45.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.447411  normal  0.123805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  22.55 
 
 		 1112 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  25.25 
 
 		 1137 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  25.25 
 
 		 1137 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 559 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  24.88 
 
 		 559 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  27 
 
 		 1131 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.87 
 
 		 1104 aa  44.3  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 1138 aa  44.3  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  25.25 
 
 		 1137 aa  44.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  28.57 
 
 		 1098 aa  44.3  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  25.25 
 
 		 1137 aa  44.3  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  25 
 
 		 548 aa  44.3  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  21.8 
 
 		 645 aa  44.3  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  23.72 
 
 		 576 aa  43.9  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  24.59 
 
 		 566 aa  44.3  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>