More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4686 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  82.83 
 
 		 559 aa  969    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  59.75 
 
 		 564 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  99.64 
 
 		 559 aa  1138    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 559 aa  1145    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  61 
 
 		 556 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  58.19 
 
 		 563 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 559 aa  1145    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  55.96 
 
 		 552 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  54.79 
 
 		 521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  53.1 
 
 		 548 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  52.1 
 
 		 548 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  51.92 
 
 		 558 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  48.26 
 
 		 544 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  48.44 
 
 		 543 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  46.41 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  46.04 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  46.18 
 
 		 555 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  46.7 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  46.04 
 
 		 553 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  46.62 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  46.28 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  45.16 
 
 		 554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  43.74 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  45.02 
 
 		 540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  41.25 
 
 		 570 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  42.18 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  39.68 
 
 		 540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  39.78 
 
 		 551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.73 
 
 		 591 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  40.55 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  41.38 
 
 		 1123 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  38.93 
 
 		 1061 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  39.43 
 
 		 1098 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  39.96 
 
 		 572 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  40.14 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  42.44 
 
 		 1154 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  42.24 
 
 		 1154 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  40.93 
 
 		 1108 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  38.77 
 
 		 1098 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 		 1138 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  39.96 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  41.41 
 
 		 1152 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  40.55 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  41.32 
 
 		 601 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  39.59 
 
 		 548 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  42.14 
 
 		 1106 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  39 
 
 		 1108 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  38.11 
 
 		 1100 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  38.84 
 
 		 1093 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  42.74 
 
 		 1130 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  38.66 
 
 		 1093 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  40.26 
 
 		 577 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  39.32 
 
 		 1098 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  40.07 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  41.51 
 
 		 1106 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  41.32 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  37.93 
 
 		 1137 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  42.3 
 
 		 1131 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  42.3 
 
 		 1131 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  41.58 
 
 		 1108 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  41.82 
 
 		 1136 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  42.09 
 
 		 1131 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  39.45 
 
 		 1100 aa  388  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  37.91 
 
 		 1098 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  40.18 
 
 		 562 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  42.14 
 
 		 1105 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  42.03 
 
 		 1137 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  42.03 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  38.11 
 
 		 1137 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  39.07 
 
 		 572 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  42.03 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  41.6 
 
 		 1106 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  42.3 
 
 		 1131 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  42.3 
 
 		 1131 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  42.3 
 
 		 1131 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  40.37 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  39.03 
 
 		 1139 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1160 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  38.38 
 
 		 1121 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  40.28 
 
 		 1119 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  40.33 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  38.42 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  40.3 
 
 		 1114 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  38.6 
 
 		 556 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  39.46 
 
 		 596 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  40.83 
 
 		 558 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  39.19 
 
 		 1099 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  38.42 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  39.46 
 
 		 596 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  38.74 
 
 		 1100 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  37.13 
 
 		 1142 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  37.14 
 
 		 1104 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  40.9 
 
 		 1113 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  38.35 
 
 		 1088 aa  381  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  39.31 
 
 		 1100 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  41.27 
 
 		 1108 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  38.35 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  37.61 
 
 		 1092 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  41.3 
 
 		 1116 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>