43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2774 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  73.1 
 
 		 687 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  73.25 
 
 		 687 aa  1055    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  55.21 
 
 		 774 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  98.11 
 
 		 688 aa  1385    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  53.47 
 
 		 758 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  56.34 
 
 		 756 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  100 
 
 		 688 aa  1408    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  53.91 
 
 		 764 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  56.34 
 
 		 756 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  96.51 
 
 		 688 aa  1365    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  91.86 
 
 		 688 aa  1312    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  52.54 
 
 		 744 aa  737    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  55.56 
 
 		 752 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  64.62 
 
 		 687 aa  932    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  56.34 
 
 		 756 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  41.61 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  29.2 
 
 		 855 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1082 aa  239  9e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  27.84 
 
 		 731 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  26.39 
 
 		 736 aa  132  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  24.25 
 
 		 553 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  23.18 
 
 		 646 aa  51.2  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0801  alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 		 543 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  23.49 
 
 		 553 aa  48.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  27.36 
 
 		 964 aa  48.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  27.27 
 
 		 616 aa  47.8  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  24.41 
 
 		 559 aa  47.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3616  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.381116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3684  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.942466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3611  alpha amylase, catalytic region  28.64 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275383  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  24.92 
 
 		 548 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0921  alpha amylase  23.69 
 
 		 568 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0194055 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  23.89 
 
 		 553 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8467  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 544 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0947398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  26.56 
 
 		 559 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  26.56 
 
 		 559 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 		 559 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  26.27 
 
 		 560 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  23.72 
 
 		 563 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2981  alpha amylase catalytic region  24.43 
 
 		 540 aa  44.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000947876  normal  0.0148383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  24.44 
 
 		 555 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01920  glycosidase  25.11 
 
 		 607 aa  43.9  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  25.71 
 
 		 1099 aa  43.9  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>