38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3330 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  100 
 
 
717 aa  1463    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  42.44 
 
 
764 aa  535  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  41.7 
 
 
756 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  41.7 
 
 
756 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  41.7 
 
 
756 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  41.61 
 
 
688 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  43.49 
 
 
758 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  41.58 
 
 
687 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  41.75 
 
 
688 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  42.43 
 
 
774 aa  492  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  41.9 
 
 
687 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  40.95 
 
 
752 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  41.26 
 
 
688 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  41.61 
 
 
688 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  41.75 
 
 
687 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  40.5 
 
 
744 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  29.67 
 
 
855 aa  253  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  29.17 
 
 
731 aa  238  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  26.06 
 
 
1082 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  24.58 
 
 
736 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 
570 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2991  alpha amylase catalytic region  34.57 
 
 
479 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2906  Alpha amylase, catalytic region  33.73 
 
 
524 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  25.82 
 
 
639 aa  48.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  25.67 
 
 
617 aa  48.5  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  23.28 
 
 
1088 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  25 
 
 
579 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  29.21 
 
 
586 aa  48.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  23.91 
 
 
582 aa  47.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3096  alpha amylase catalytic region  32.72 
 
 
479 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 
576 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  28.85 
 
 
617 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  31.78 
 
 
605 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  32.35 
 
 
586 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  32.35 
 
 
586 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  32.35 
 
 
586 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  32.35 
 
 
586 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  32.35 
 
 
586 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>