More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3114 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  54.92 
 
 		 540 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  58.39 
 
 		 570 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  55.93 
 
 		 541 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 579 aa  1207    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  55.43 
 
 		 553 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  54.88 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  53.51 
 
 		 553 aa  614  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  53.87 
 
 		 554 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  53.49 
 
 		 554 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  52.93 
 
 		 554 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  52.49 
 
 		 554 aa  594  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  50.55 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  48.16 
 
 		 543 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  46.25 
 
 		 544 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  43.98 
 
 		 548 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  45.5 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  43.98 
 
 		 558 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  44.61 
 
 		 548 aa  485  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  46.57 
 
 		 564 aa  481  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  45.27 
 
 		 559 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  44.38 
 
 		 552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  43.92 
 
 		 559 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  43.01 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  43.74 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  43.74 
 
 		 559 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  44.44 
 
 		 563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  43.51 
 
 		 540 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  44.63 
 
 		 535 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  41.56 
 
 		 548 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  41.73 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  41.89 
 
 		 556 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  40.15 
 
 		 1100 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  40.22 
 
 		 1123 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  40.85 
 
 		 1102 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  41.3 
 
 		 1094 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  39.71 
 
 		 1101 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  40.33 
 
 		 1098 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  40.62 
 
 		 1102 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  40.62 
 
 		 1102 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  39.78 
 
 		 1100 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  39.78 
 
 		 1100 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  39.85 
 
 		 1115 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  41.28 
 
 		 553 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  40.26 
 
 		 1093 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  40 
 
 		 544 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  40.37 
 
 		 1085 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  40.3 
 
 		 1088 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  39.67 
 
 		 1104 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  40.14 
 
 		 1113 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  40.62 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  40.81 
 
 		 572 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  41.3 
 
 		 1101 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  39.31 
 
 		 1100 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  39.27 
 
 		 1099 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  39.67 
 
 		 1100 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  40.6 
 
 		 1108 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  39.41 
 
 		 1121 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  39.6 
 
 		 1093 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  40.3 
 
 		 1088 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  39.11 
 
 		 588 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  40.62 
 
 		 572 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  39.93 
 
 		 1114 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  39.96 
 
 		 1092 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  39.11 
 
 		 1061 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  39.53 
 
 		 1121 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  42.91 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  44.16 
 
 		 1119 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  40.3 
 
 		 1088 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  40.22 
 
 		 1088 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  43.51 
 
 		 1108 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.55 
 
 		 591 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  38.41 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  40.11 
 
 		 1088 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  38.97 
 
 		 1088 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0587  alpha amylase catalytic region  41.52 
 
 		 552 aa  399  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  39.41 
 
 		 1154 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  39.85 
 
 		 1099 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  39.23 
 
 		 1152 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  39.93 
 
 		 1137 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  39.75 
 
 		 556 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  43.31 
 
 		 1130 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  39.34 
 
 		 1098 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  40.3 
 
 		 1111 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  39.32 
 
 		 1106 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  39.67 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  38.86 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  39.23 
 
 		 606 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  38.67 
 
 		 1095 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  39.67 
 
 		 1100 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  39.93 
 
 		 1098 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  39.74 
 
 		 1137 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  39.11 
 
 		 1100 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  39.35 
 
 		 1110 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  39.33 
 
 		 1136 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  39.23 
 
 		 1154 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  39.93 
 
 		 1137 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  39.32 
 
 		 1106 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  40.11 
 
 		 1138 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  39.93 
 
 		 1137 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  39.23 
 
 		 1109 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>