More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3723 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  83.18 
 
 		 559 aa  976    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  63.69 
 
 		 556 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  82.83 
 
 		 559 aa  969    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 559 aa  1142    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  60.92 
 
 		 564 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  59.33 
 
 		 563 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  82.83 
 
 		 559 aa  969    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  56.73 
 
 		 552 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  55.43 
 
 		 521 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  52.09 
 
 		 548 aa  568  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  50.72 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  50.72 
 
 		 558 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  47.52 
 
 		 544 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  48.44 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  47.71 
 
 		 554 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  47.17 
 
 		 554 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  46.22 
 
 		 553 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  47.15 
 
 		 553 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  47.34 
 
 		 555 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  45.67 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  47.15 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  45.8 
 
 		 554 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  46.32 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  45.27 
 
 		 579 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  46.13 
 
 		 540 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  41.51 
 
 		 570 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  42.05 
 
 		 540 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  41.68 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  39.13 
 
 		 551 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  40.62 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.54 
 
 		 591 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  40.8 
 
 		 572 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  40.62 
 
 		 572 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  38.97 
 
 		 1154 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  38.29 
 
 		 1061 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  38.83 
 
 		 1123 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  37.57 
 
 		 1152 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  38.97 
 
 		 1154 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  39.46 
 
 		 1121 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  39.15 
 
 		 1138 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  39.3 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  39.46 
 
 		 1139 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  38.42 
 
 		 1136 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  38.81 
 
 		 606 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  38.56 
 
 		 1095 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  38.41 
 
 		 1098 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  38.11 
 
 		 1093 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  38.6 
 
 		 1137 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  39.42 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  38.6 
 
 		 1137 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  37.96 
 
 		 1100 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  39.06 
 
 		 1130 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  38.42 
 
 		 1137 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  38.6 
 
 		 1137 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  39.77 
 
 		 1108 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  38.2 
 
 		 1106 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  40.18 
 
 		 1098 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  37.32 
 
 		 1104 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  37.91 
 
 		 1098 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  39.56 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  40.37 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  38.38 
 
 		 1100 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  38.09 
 
 		 1099 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  38.24 
 
 		 1137 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  37.93 
 
 		 1093 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  38.38 
 
 		 1105 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  36.96 
 
 		 1100 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  38.36 
 
 		 1164 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  38.7 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  37.75 
 
 		 1098 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  38.36 
 
 		 1164 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  37.48 
 
 		 1101 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  39.31 
 
 		 1111 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  40.07 
 
 		 601 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  37.46 
 
 		 1108 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  37.87 
 
 		 1131 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  37.46 
 
 		 1108 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  37.61 
 
 		 1113 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  38.36 
 
 		 1100 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  37.11 
 
 		 1100 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  38.05 
 
 		 1131 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  40.73 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  38.81 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  37.57 
 
 		 551 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  37.68 
 
 		 1108 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  40.99 
 
 		 544 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  38.05 
 
 		 1131 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  38.05 
 
 		 1131 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  38.05 
 
 		 1131 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  38.05 
 
 		 1131 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  37.48 
 
 		 1106 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  38.36 
 
 		 1160 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  37.57 
 
 		 1102 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  37.64 
 
 		 1100 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  37.75 
 
 		 1102 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  37.02 
 
 		 1100 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  38.13 
 
 		 1099 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  38.62 
 
 		 1100 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  37.48 
 
 		 1106 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  37.02 
 
 		 1142 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>