169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2402 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  53.32 
 
 		 688 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  52.37 
 
 		 687 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  52.43 
 
 		 687 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  52.51 
 
 		 687 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  100 
 
 		 758 aa  1559    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  59.49 
 
 		 756 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  59.49 
 
 		 756 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  60.75 
 
 		 752 aa  893    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  59.63 
 
 		 756 aa  888    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  65.78 
 
 		 764 aa  1025    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  58.87 
 
 		 744 aa  869    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  53.47 
 
 		 688 aa  713    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  59.56 
 
 		 774 aa  839    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  53.47 
 
 		 688 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  53.77 
 
 		 688 aa  727    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  43.49 
 
 		 717 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  30.95 
 
 		 855 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  29.03 
 
 		 731 aa  232  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1082 aa  223  9e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  25.11 
 
 		 736 aa  150  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  24.42 
 
 		 1112 aa  63.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  21.73 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  24.15 
 
 		 1100 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  24.91 
 
 		 1088 aa  61.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  22.5 
 
 		 649 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  23.81 
 
 		 1100 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  24.62 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  25.34 
 
 		 1094 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  22.96 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  22.96 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  22.96 
 
 		 559 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  24.83 
 
 		 1099 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  23.81 
 
 		 1100 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  25.15 
 
 		 1142 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5859  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  22.92 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  23.79 
 
 		 533 aa  56.6  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  21.09 
 
 		 538 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3169  alpha amylase, catalytic region  23.4 
 
 		 530 aa  55.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  25.43 
 
 		 616 aa  55.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  23.85 
 
 		 551 aa  54.7  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  25.67 
 
 		 554 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1931  alpha amylase, catalytic region  23.68 
 
 		 541 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.126366  normal  0.0171494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  23.08 
 
 		 525 aa  54.7  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  25 
 
 		 548 aa  54.7  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  24.48 
 
 		 551 aa  54.3  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  24.71 
 
 		 598 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  24.92 
 
 		 1102 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 553 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0062  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 553 aa  51.6  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.3547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7356  conserved hypothetical protein; K01187 alpha- glucosidase  25.43 
 
 		 511 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  24.23 
 
 		 964 aa  51.6  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  23.7 
 
 		 587 aa  51.2  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5268  alpha amylase catalytic region  22.93 
 
 		 540 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  21.84 
 
 		 554 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  21.09 
 
 		 650 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  24.23 
 
 		 1152 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  21.96 
 
 		 559 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3104  trehalose-6-phosphate hydrolase  21.58 
 
 		 515 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0986221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  21.84 
 
 		 554 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  21.84 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  21.84 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  21.84 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  21.84 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  27.27 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  25.08 
 
 		 596 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  25.08 
 
 		 596 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  21.84 
 
 		 554 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  25.08 
 
 		 596 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  23.39 
 
 		 1101 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1595  alpha amylase catalytic region  23.75 
 
 		 528 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0451037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0810  alpha amylase, catalytic region  23.76 
 
 		 540 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1848  alpha-glucosidase  24.06 
 
 		 541 aa  48.9  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 577 aa  49.3  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  22.26 
 
 		 622 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02470  Alpha-glucosidase  24.39 
 
 		 576 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.914818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  24.01 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3077  alpha amylase catalytic region  23.4 
 
 		 535 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 		 1104 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  23.5 
 
 		 556 aa  48.5  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  25.7 
 
 		 605 aa  48.5  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0622  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 609 aa  48.5  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  25.96 
 
 		 1110 aa  48.5  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  21.18 
 
 		 1115 aa  48.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  20.92 
 
 		 570 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  22.92 
 
 		 583 aa  48.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  21.46 
 
 		 554 aa  48.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  22.97 
 
 		 1101 aa  47.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1785  alpha amylase catalytic region  24.9 
 
 		 599 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  26.5 
 
 		 1108 aa  47.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  23.96 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  23.81 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0917  alpha amylase, catalytic region  23.27 
 
 		 542 aa  47.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  24.12 
 
 		 567 aa  47.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  23.81 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  25.7 
 
 		 1134 aa  47  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  24.43 
 
 		 598 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  23.03 
 
 		 562 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>