20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2414 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2414  hypothetical protein  100 
 
 
855 aa  1711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3114  hypothetical protein  39.35 
 
 
1082 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000894612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1839  hypothetical protein  37.14 
 
 
731 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3580  trehalose synthase  29.63 
 
 
764 aa  260  9e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2402  trehalose synthase  29.68 
 
 
758 aa  256  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000104329  hitchhiker  0.000210586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3330  trehalose synthase  29.67 
 
 
717 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2918  trehalose synthase  29.16 
 
 
688 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2774  trehalose synthase  28.92 
 
 
688 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.461538  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3747  trehalose synthase  30.13 
 
 
774 aa  250  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.552498  decreased coverage  0.00192759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1577  trehalose synthase  30.28 
 
 
744 aa  249  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515336  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2736  glycosidase, putative  30.38 
 
 
687 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.506045  normal  0.231519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2952  glycosidase, putative  30.32 
 
 
687 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2116  trehalose synthase  29.22 
 
 
688 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431979  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7407  trehalose synthase  30.76 
 
 
687 aa  247  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5178  trehalose synthase  30.18 
 
 
752 aa  245  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.365821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2864  trehalose synthase  28.82 
 
 
688 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403012  normal  0.711488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0335  trehalose synthase  30.51 
 
 
756 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.749024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0356  trehalose synthase  30.51 
 
 
756 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.375645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0346  trehalose synthase  30.51 
 
 
756 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0549  hypothetical protein  32.71 
 
 
736 aa  233  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>