197 genes were found for organism Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Avi_9001  CDS  NC_011984  109  1308  +  1200  replication protein A  YP_002542549  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9002  CDS  NC_011984  1391  2368  +  978  replication protein B  YP_002542550  normal  0.585247  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9003  CDS  NC_011984  2556  3833  +  1278  replication initiation protein RepC  YP_002542551  normal  0.854777  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9004  CDS  NC_011984  3839  4780  -  942  DNA invertase  YP_002542552  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9007  CDS  NC_011984  6113  7192  +  1080  two component sensor kinase  YP_002542553  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9008  CDS  NC_011984  7500  8633  -  1134  phage integrase family protein  YP_002542554  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9009  CDS  NC_011984  8746  9711  +  966  hypothetical protein  YP_002542555  normal  0.148116  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9010  CDS  NC_011984  9973  10422  +  450  hypothetical protein  YP_002542556  normal  0.21316  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9011  CDS  NC_011984  10412  10786  -  375  hypothetical protein  YP_002542557  normal  0.371394  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9013  CDS  NC_011984  10791  11003  -  213  Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)  YP_002542558  normal  0.167373  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9014  CDS  NC_011984  11140  11832  +  693  hypothetical protein  YP_002542559  normal  0.19539  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9017    NC_011984  13074  13376  -  303      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9018    NC_011984  13373  13903  -  531      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9019  CDS  NC_011984  13900  14274  -  375  transposase  YP_002542560  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9020  CDS  NC_011984  14326  15093  -  768  integrase/recombinase  YP_002542561  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9021    NC_011984  15431  16293  +  863      normal  0.722719  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9024    NC_011984  16372  16782  +  411      normal  0.227662  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9026  CDS  NC_011984  17042  17995  -  954  sensory transduction histidine kinase  YP_002542562  normal  0.157622  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9028  CDS  NC_011984  18104  18475  -  372  two component sensor kinase/response regulator hybrid  YP_002542563  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9030  CDS  NC_011984  18707  19432  -  726  hypothetical protein  YP_002542564  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9031    NC_011984  19582  21700  -  2119      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9035  CDS  NC_011984  21766  22341  -  576  transposase IS4 family protein  YP_002542565  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9036  CDS  NC_011984  22412  22726  -  315  hypothetical protein  YP_002542566  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9037  CDS  NC_011984  23098  24783  +  1686  hypothetical protein  YP_002542567  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9038  CDS  NC_011984  24776  25312  +  537  hypothetical protein  YP_002542568  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9039  CDS  NC_011984  25407  26138  -  732  transposase  YP_002542569  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9041  CDS  NC_011984  26163  28268  -  2106  two component sensor kinase/response regulator hybrid  YP_002542570  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9042  CDS  NC_011984  28639  29355  -  717  transposase  YP_002542571  normal  0.276584  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9043  CDS  NC_011984  29502  29999  -  498  hypothetical protein  YP_002542572  normal  0.034068  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9044  CDS  NC_011984  30063  30977  -  915  hypothetical protein  YP_002542573  normal  0.0742912  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9047  CDS  NC_011984  30995  31510  -  516  chemotaxis response regulator  YP_002542574  normal  0.0295266  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9049  CDS  NC_011984  31975  32436  +  462  Transcriptional regulator  YP_002542575  normal  0.578092  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9050  CDS  NC_011984  32650  32895  +  246  Phage envelope protein  YP_002542576  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9052  CDS  NC_011984  33087  34187  +  1101  polyhydroxybutyrate depolymerase  YP_002542577  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9053  CDS  NC_011984  34433  35254  +  822  hypothetical protein  YP_002542578  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9054  CDS  NC_011984  35626  36870  -  1245  hypothetical protein  YP_002542579  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9055  CDS  NC_011984  36863  37198  -  336  hypothetical protein  YP_002542580  normal  0.142837  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9056  CDS  NC_011984  37429  39786  +  2358  hypothetical protein  YP_002542581  normal  0.172893  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9057  CDS  NC_011984  39913  40578  -  666  hypothetical protein  YP_002542582  normal  0.19539  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9059  CDS  NC_011984  40715  40927  +  213  Translation initiation factor 2 (IF-2; GTPase)  YP_002542583  normal  0.0953777  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9061  CDS  NC_011984  40932  41306  +  375  hypothetical protein  YP_002542584  normal  0.0541553  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9064    NC_011984  41649  42155  +  507      normal  0.170074  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9065  CDS  NC_011984  42169  43698  -  1530  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_002542585  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9066  CDS  NC_011984  43937  44251  +  315  IS298 transposase OrfA  YP_002542586  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9067  CDS  NC_011984  44322  44717  +  396  transposase  YP_002542587  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9068  CDS  NC_011984  45005  45976  -  972  transcriptional regulator AraC family  YP_002542588  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9071  CDS  NC_011984  46632  47027  -  396  hypothetical protein  YP_002542589  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9072  CDS  NC_011984  47098  47412  -  315  hypothetical protein  YP_002542590  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9073  CDS  NC_011984  47521  48102  +  582  hypothetical protein  YP_002542591  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9074  CDS  NC_011984  48487  48798  -  312  hypothetical protein  YP_002542592  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9075  CDS  NC_011984  48919  50595  +  1677  hypothetical protein  YP_002542593  normal  0.979947  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9076  CDS  NC_011984  50659  52497  +  1839  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_002542594  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9077  CDS  NC_011984  52940  53986  +  1047  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_002542595  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9079  CDS  NC_011984  54054  54428  +  375  transposase  YP_002542596  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9080    NC_011984  54425  55828  +  1404      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9083  CDS  NC_011984  55855  58425  -  2571  bacteriophytochrome protein  YP_002542597  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9084  CDS  NC_011984  58448  59395  -  948  transcriptional regulator AraC family  YP_002542598  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9088  CDS  NC_011984  60362  62647  +  2286  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_002542599  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9090    NC_011984  62954  64046  -  1093      normal  0.233817  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9092    NC_011984  64085  64798  +  714      normal  0.391185  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9093  CDS  NC_011984  64855  65088  +  234  hypothetical protein  YP_002542600  normal  0.313804  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9094    NC_011984  65069  66728  -  1660      normal  0.288319  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9096  CDS  NC_011984  66774  67127  -  354  transposition-related protein  YP_002542601  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9097  CDS  NC_011984  67124  67612  -  489  TRm1a transposase  YP_002542602  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9098  CDS  NC_011984  67960  69096  -  1137  bacteriophytochrome protein  YP_002542603  normal  0.384054  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9099  CDS  NC_011984  69096  69665  -  570  protein-glutamate methylesterase  YP_002542604  normal  0.141015  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9100  CDS  NC_011984  69662  70495  -  834  chemotaxis methyltransferase  YP_002542605  normal  0.437866  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9103  CDS  NC_011984  70492  73929  -  3438  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_002542606  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9104  CDS  NC_011984  74206  74586  +  381  hypothetical protein  YP_002542607  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9105  CDS  NC_011984  74603  75058  +  456  hypothetical protein  YP_002542608  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9106  CDS  NC_011984  75091  75744  +  654  hypothetical protein  YP_002542609  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9108  CDS  NC_011984  75741  76172  +  432  pilT protein, N-terminal  YP_002542610  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9109  CDS  NC_011984  76207  77067  -  861  hypothetical protein  YP_002542611  normal  0.689253  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9110    NC_011984  77064  77647  -  584      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9111    NC_011984  77800  78583  +  784      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9112    NC_011984  78649  78846  -  198      normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9114  CDS  NC_011984  79068  79436  -  369  transposase protein  YP_002542612  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9115  CDS  NC_011984  79451  79828  -  378  transposase protein  YP_002542613  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9116  CDS  NC_011984  79930  80811  +  882  molybdopterin biosynthesis protein  YP_002542614  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9117  CDS  NC_011984  80928  81428  +  501  hypothetical protein  YP_002542615  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9118  CDS  NC_011984  81683  83116  -  1434  pyruvate kinase  YP_002542616  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9119  CDS  NC_011984  83123  84358  -  1236  hydroxypyruvate reductase  YP_002542617  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9120  CDS  NC_011984  84388  85476  -  1089  tartrate dehydrogenase  YP_002542618  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9121  CDS  NC_011984  85498  86796  -  1299  MFS permease  YP_002542619  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9122  CDS  NC_011984  86920  87834  +  915  transcriptional regulator LysR family  YP_002542620  normal  0.272259  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9123  CDS  NC_011984  88238  88753  -  516  gluconokinase  YP_002542621  normal  0.177068  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9124  CDS  NC_011984  88901  89671  -  771  gluconate 5-dehydrogenase  YP_002542622  normal  0.991877  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9125  CDS  NC_011984  89674  91161  -  1488  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  YP_002542623  normal  0.239655  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9126  CDS  NC_011984  91158  92210  -  1053  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  YP_002542624  normal  0.364667  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9127  CDS  NC_011984  92339  93454  -  1116  sugar ABC transporter (sugar-binding protein)  YP_002542625  normal  0.392658  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9128  CDS  NC_011984  93805  95847  +  2043  hydantoin utilization protein  YP_002542626  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9129  CDS  NC_011984  95913  97835  +  1923  hydantoin utilization protein  YP_002542627  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9130  CDS  NC_011984  97851  99242  +  1392  aminotransferase  YP_002542628  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9131  CDS  NC_011984  99284  100354  +  1071  transcriptional regulator LacI family  YP_002542629  normal  0.897881  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9132  CDS  NC_011984  100905  101066  -  162  transposase  YP_002542630  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9134  CDS  NC_011984  101338  102495  -  1158  transposase  YP_002542631  normal  0.220032  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9135  CDS  NC_011984  102532  103074  -  543  transposase  YP_002542632  normal  0.0658372  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9137    NC_011984  103124  103696  +  573      normal  0.78632  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9138    NC_011984  103779  104066  +  288      normal  0.826917  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Avi_9140  CDS  NC_011984  104195  105196  -  1002  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  YP_002542633  normal  1  n/a    Agrobacterium vitis S4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>