74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9097 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9097  TRm1a transposase  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  99.33 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  99.33 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  99.33 
 
 		 150 aa  302  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  34.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  34.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  26.71 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  29.73 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  29.55 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  30.37 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  31.06 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  40.58 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  30.47 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  29.55 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  32.43 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  32.43 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  37.7 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  30.39 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  31.76 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  31.76 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  31.76 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  35.53 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  26.98 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  31.76 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  31.76 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  31.76 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  31.76 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  31.76 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  31.76 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  38.81 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  39.19 
 
 		 107 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  26.32 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  26.32 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  34.43 
 
 		 122 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  32.39 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>