212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4862 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  100 
 
 
129 aa  263  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  99.22 
 
 
129 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  99.22 
 
 
129 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  99.22 
 
 
129 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  99.22 
 
 
129 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  98.45 
 
 
133 aa  260  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  98.45 
 
 
133 aa  259  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5041  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
53 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1181  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
53 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1310  IS66 family element, orf1  98.11 
 
 
53 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  43.2 
 
 
225 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  43.2 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  43.2 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  43.2 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  43.2 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  43.2 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  43.2 
 
 
225 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  38.21 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  36.97 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  42.45 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  34.65 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  35.29 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  36.8 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  37.88 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  38.69 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  39.52 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  37.12 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  47.95 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  47.3 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  54 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  32.03 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  38.46 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  39.24 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  33.66 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  37.61 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  35.83 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  31.93 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  29.23 
 
 
224 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  47.92 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  31.9 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  32.35 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  39.47 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  32.11 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  32.93 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  40.32 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 
172 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  30.58 
 
 
149 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  30.58 
 
 
149 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  35.62 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  35.79 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  30.49 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  30.49 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  37.14 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  37.14 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  33.66 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  25.86 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  25.86 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  28.74 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  28.74 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>