183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4842 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 131 aa  249  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  94.66 
 
 		 131 aa  234  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  96.67 
 
 		 131 aa  225  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  43.88 
 
 		 283 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  40.57 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  36.13 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  36.13 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  37.7 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  30.71 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  35.04 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  51.72 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  51.72 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  32.59 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  35.04 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  35.04 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  48.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  48.28 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  48.28 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  48.21 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  52.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  52.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  52.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  52.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  52.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  52.94 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  32.03 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  33.87 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  35.29 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  49.02 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  49.02 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  49.02 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.98 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  46.55 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4610  transposase IS3/IS911 family protein  35.45 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695949  normal  0.162062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  50.91 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  32.23 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  34.65 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  33.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  58.14 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  40.68 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  33.33 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  35.51 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  33.33 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  31.51 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  27.89 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  27.89 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  36.76 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  36.11 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9097  TRm1a transposase  29.55 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  32.53 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  38.27 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  31.36 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  33.6 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  50.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  50.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  33.02 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  50.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  34.29 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  50.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  50.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  34.67 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  34.67 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  50 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>