152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4987 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  100 
 
 		 113 aa  223  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6728  hypothetical protein  82.14 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.492045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  41.88 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  38.32 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  36.7 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  37.19 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  37.19 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  39.52 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  41.56 
 
 		 283 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  33.06 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  37.21 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  27.36 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  29.41 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  35.09 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  35.09 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  35.34 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  51.11 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4610  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695949  normal  0.162062 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  40.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  26.87 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  40.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  31.18 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9097  TRm1a transposase  40.58 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  40.58 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  29.51 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  29.51 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  29.51 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  34.19 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  34.19 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  34.19 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  27.36 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  23.77 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  37.66 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  30.51 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.51 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.51 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.51 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  33.91 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  53.19 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  33.91 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.51 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  36.76 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  33.63 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  36.23 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  36.23 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  36.23 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  36.23 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  36.76 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  36.76 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  35.29 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  34.21 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  35.29 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  28.83 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  28.83 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  27.59 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  29.9 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  28.83 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  28.83 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  31.43 
 
 		 154 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  41.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  41.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  41.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  41.86 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  31.48 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  28.83 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  28.83 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  28.83 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>