100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4780 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  61.24 
 
 		 128 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  44.09 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  69.84 
 
 		 86 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  36.75 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  58.7 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  43.18 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  42.05 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  49.02 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  49.02 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  46.55 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  46.55 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  46.55 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  46.55 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  46.55 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  46.55 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  32.52 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  42.62 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.55 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.55 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.55 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  46.55 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  36.46 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  43.1 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  45.31 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4959  hypothetical protein  39.73 
 
 		 298 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00383302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  48.94 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  40.79 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  40.79 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  40.79 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  34.45 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  32.48 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  47.83 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  33.05 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  49.02 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  32.48 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  37.25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  43.64 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  43.64 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  32.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  32.73 
 
 		 155 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  32.73 
 
 		 155 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  28.44 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  45.1 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  26.45 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  41.67 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  41.67 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  26.09 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  26.09 
 
 		 225 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  26.09 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  26.09 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  26.09 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  26.09 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  36.07 
 
 		 134 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 98 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  36.07 
 
 		 134 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  35.29 
 
 		 141 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 98 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 98 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  45.24 
 
 		 136 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>