117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2121 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  100 
 
 
141 aa  289  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  99.29 
 
 
141 aa  286  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  82.98 
 
 
139 aa  239  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  82.27 
 
 
139 aa  237  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  90.83 
 
 
120 aa  225  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  84.17 
 
 
120 aa  210  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4293  IS66 family transposase OrfA  94.23 
 
 
52 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  37.78 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  37.78 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  37.78 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  37.78 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  37.78 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  37.78 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  37.78 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  34.27 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  37.12 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  37.12 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  37.12 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  37.12 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  37.12 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  37.12 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  37.12 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  36.44 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  30.91 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  28.44 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  28.44 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  28.44 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  28.44 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  44.19 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
126 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  29.57 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  29.73 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  29.73 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  35.23 
 
 
131 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  26.96 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  38.3 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  37.5 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  27.56 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  31.48 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  28.95 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
113 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  28.03 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  33.82 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  33.82 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  39.58 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  33.33 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  29.49 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  29.49 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  29.49 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.67 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.67 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.67 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  40.43 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  40.43 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  40.43 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  39.58 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  37.88 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.58 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  38.98 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  31.94 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>