227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1057 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
135 aa  277  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
135 aa  277  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
135 aa  277  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  99.26 
 
 
135 aa  275  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  37.1 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  36.73 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  36.73 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  41.86 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  37.97 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  40.24 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  40.24 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  37.97 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  32.23 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  43.84 
 
 
224 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  29.36 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  36.84 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  28.44 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  38.96 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  32.18 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  33.65 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  26.4 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  26.4 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  27.42 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  36 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  25.66 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  36.62 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  32.18 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  27.91 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  28.23 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  40.91 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.13 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  41.3 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  41.3 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  41.3 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  41.3 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  41.3 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  41.3 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  36.96 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  36.96 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  32.26 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2691  protein of unknown function DUF1528  41.51 
 
 
282 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  32.26 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  36.96 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  28.74 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  36.92 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  28.16 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  35.94 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0946  transposase IS3/IS911 family protein  33.73 
 
 
415 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.365915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  27.27 
 
 
106 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  36.49 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  33.33 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>