201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8374 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  75.17 
 
 
139 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  51.08 
 
 
154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
146 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  53.06 
 
 
151 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  41.54 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  41.54 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  63.16 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  39.84 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  54.24 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  39.69 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  39.2 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  44.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  44.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  44.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  44.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  44.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  44.29 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  50 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  50 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  33.08 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.33 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.33 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.33 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.33 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  30.08 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  30.08 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  36.7 
 
 
133 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  44.3 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  56 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  44.59 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  40.28 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  31.85 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  32.76 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  36.3 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  34.88 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  32.54 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  50.94 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  50.94 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  50.94 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  49.06 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  49.06 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  42.47 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  42.47 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  33.33 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  46.15 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  34.48 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  38.46 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  53.45 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  45.76 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  36.22 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  29.92 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  30.63 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  41.54 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  41.54 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  41.54 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  41.54 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  41.54 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  41.43 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>