156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3008 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 154 aa  308  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  67.72 
 
 		 151 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  51.08 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  51.08 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  51.08 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  54.74 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  50.7 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  85.71 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  46.9 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  42.02 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  42.02 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  42.02 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  47.67 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  33.09 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  33.09 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.47 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.47 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  39.47 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  39.47 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  39.47 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  39.47 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  39.47 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  39.47 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.47 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.87 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  43.21 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  35.51 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  49.32 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  35.51 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  33.59 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  37.8 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  37.8 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  45.21 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  45.21 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  32.59 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  34.11 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  47.83 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  30.56 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  47.3 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  34.68 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  33.83 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  33.83 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  39.8 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  32.43 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  39.66 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  52.38 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  42.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  38.41 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  58.7 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  35.59 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  56.6 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  43.66 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  36.19 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  35.34 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  35.34 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  46.3 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  46.3 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  36.19 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  33.98 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>